A história de Alvarães tem raízes profundas no município de Tefé, do qual se originou. Em 1º de dezembro de 1938, por meio da lei estadual nº 176, o então distrito de Caiçara foi incorporado ao município de Tefé, estabelecendo as bases administrativas da região.

A denominação de Caiçara refletia as tradições locais e a ligação intrínseca da comunidade com o rio e a floresta — elementos centrais na vida dos habitantes da região amazônica. O nome foi transformado para Alvarães pelo decreto-lei estadual nº 1.186, de 31 de outubro de 1943, simbolizando um novo capítulo na identidade regional.

A jornada rumo à autonomia culminou em 10 de dezembro de 1981, quando a emenda constitucional nº 12 emancipou o distrito, tornando Alvarães um município independente. Este ato reafirmou seu papel crucial na região do Triângulo do Jutaí, Juruá e Solimões.

Hoje, Alvarães é um município profundamente ligado aos rios, lagos e à floresta amazônica. As famílias ribeirinhas vivem da pesca artesanal, da agricultura familiar — principalmente do cultivo da mandioca — e da coleta de frutos regionais, mantendo viva a essência da Amazônia.